Muv-Luv ATE全名为《Muv-Luv Alternative Total eclipse 》，全集动画片改编自《Muv-Luv Alternative》的外传小说。故事的时间设定在西元2001年，由于人类遭到地球外起源种(联合国称其为BETA)的侵略，正面临灭亡的危机，因此人类开始了先进战术机技术开发计划“XFJ计划”，各个国家均派遣了专门人员参与其中，该作讲述的就是这些被派遣过来的人员之间的故事。（有虫子吃掉妹纸情节,反差极大,请谨慎观看.）
“……和我交往，试着加入游戏部怎样 ？”兴趣是游戏，除此之外毫无显眼的特征，仅仅是个龙套的游戏玩家雨野景太，某天突然被学园第一的美少女，游戏部部长天道花怜搭话了。由此开始，景太的日常为之一转，开始了与喜爱游戏的美少女们共度的恋爱喜剧展开的日子……本以为如此！？只有游戏的价值观不同，特立独行的女子玩家星之守千秋。班上的中心人物，虽然有女友却私下里爱好游戏的残念现充上原祐。祐的女友，毫无游戏知识的亚玖璃。将这些人物一并卷入，重复着互相误会、徒劳无功、陷入迷途，乱成一团的游戏玩家们带来的“擦肩而过青春错综系恋爱喜剧”开幕！
故事发生在日本的明治末年，石川啄木（浅沼晋太郎 配音）是拥有着极高才华的歌人，遗憾的是，才华并不能当饭吃，石川总是苦苦的挣扎在贫困线上。为了赚钱，他将自己所住的公寓改造成为了一家私人侦探所，取名为啄木鸟侦探社，专门受理社会中的疑难杂案。个性温厚老实，总是毫无怨言的协助石川办案的金田一京助（樱井孝宏 配音）、东京帝国大学的高材生野村胡堂（津田健次郎 配音）、热爱文学，对一切都充满了好奇心的青年平井太郎（小野贤章 配音）、个性害羞软弱，却总是为朋友着想的萩原朔太郎（梅原裕一郎 配音），和石川一起探索各种怪奇事件真相的，是这些可靠而又善良的朋友们。
故事讲述了在22世纪，日本国已不复存在，取而代之的是被称为“第十七极东帝都管理区”的区域。人们生活在相互信赖、生活安逸的理想世界中，但一种奇怪的致死疾病“Degration”却开始在人间肆虐。而主人公风澄彻则被卷入了与另一个世界的纷争，不得不与另一个自己展开对决…
当发现皇帝最宠爱的妃子玉波公主怀孕时，猫猫重返玉宫，继续担任试毒师。他们整天警惕着，试图阻止针对皇后和皇帝孩子的事件再次发生。新贵妃柔然入宫，她的父亲是前任皇帝时代的一位高级藩王；一桩史无前例的悬案威胁着仁慈的生活；而嫌疑人翠玲却失踪了。就在气氛紧张之际，一支来自异国的商队，甚至还有提出无理要求的特使到来。宫殿之中，云雾开始变得更加阴暗。一个新的棘手案件等待着猫猫和仁史。这些事件最终都会发展成为涉及整个国家的大事件。
星元122年――在众多企业扩展到宇宙并构筑巨大经济圈的时代，有一名少女自边境地区·水星转来MS产业的最大企业“贝纳里特集团”旗下所经营的“阿斯提卡西亚高等专门学园”。她名为苏莱塔·墨丘利。内心纯真的少女随着胸口鲜红的闪烁亮光逐步迈向新世界。
今天开始我就是狙击手……!?日常被夺走，肢体上装备名为“LBX Unit”的战术兵器的5名少女——“装甲娘”。这些被选中成为转移者的少女们的使命，是对横跨多元世界不断侵蚀、增殖的金属生命体·米梅西斯进行扫荡及歼灭。跨越时空被强加的佣兵生活，那就是得以窥见世界「希望」与「绝望」、赌上性命的修学旅行！
在《Fate/Zero》中，与征服王伊斯坎达尔一同跨越了第四次圣杯战争的少年，韦伯·维尔维特。时光流转，少年继承了君主·埃尔梅罗的称号，以君主·埃尔梅罗Ⅱ世的身份，在魔术师们的总部·时钟塔面临了各种充满神秘的事件—
这是一个忍者依旧活跃在舞台上的世界。然而和过去不同，如今的忍者多为富翁和政治家效力，帮助他们干一些见不得人的勾当，这样失去了信仰的忍者被称为“恶忍”。为了对抗日益壮大的恶忍势力，政府建立了半藏学院，将那里作为培养“善忍”的地方。天真活泼的焰（喜多村英梨 配音）、出身贫困却有着格外坚韧的意志的咏（芽野爱衣 配音）、沉默寡言丝毫不表露任何感情的日影（白石凉子 配音）、看上去像个小孩其实对自己身材十分在意的未来（后藤沙绪里 配音）、腹黑狡猾但实际上充满了母性光辉的春花（丰口惠美 配音），在学校里，这五名少女相遇了。
史莱姆生活，开始了。上班族三上悟被杀人狂魔刺死，回过神来已经转生到了异世界。不过，却是以“史莱姆”的姿态！他获得名为利姆露的全新史莱姆人生，被放逐到这个各种种族肆虐的世界，以“建立不论任何种族都能快乐度日的国家”为目标——！
讲述因抱错婴儿，让就读名门私立学校的男子高中生「海野凪」与酒店总裁千金「天野绘里香」被父母订下婚约，但凪暗恋着「濑川弥」，而凪的妹妹也对他有着不一样的心情，因此展开一场四角关系的恋爱喜剧。
第14届网络方程式WGPX。这一切都始于阿苏拉达在最后一场比赛中反对隼人的指示，而隼人对另一台机器产生了兴趣，并决定在不等待新底盘完成的情况下第 15 次挑战加兰。
蓝原柚子（竹达彩奈 配音）是一名高中一年级的女生，外表看上去非常时尚的她，实际上却是一个内心里意外的天真，一点恋爱经验都没有的纯情女孩。由于家庭的原因，柚子进入了一所女子高中就读，这让柚子的心里非常不满，因为在这里，她能交到男朋友的概率简直微乎其微。刚刚入学的第一天，柚子便和学生会长芽衣（津田美波 配音）相遇了。芽衣是学校里公认的美人，无论是外表还是成绩还是家世都将其他的同龄人远远的抛在身后。柚子因为一场误会而对芽衣的影响极为糟糕，更糟糕的是，当她回到家里时发现，芽衣竟然成为了她的义姐，两人即将住进同一屋檐下。
