第二部里，张大勇（陶大宇饰）与李忠义这对默契排档继续与狡猾凶狠的罪犯斗智斗勇。感情方面，大勇与高婕（郭可盈饰）成为斗嘴情侣，感情稳定增长。新来的女警员蓝嘉文（郭霭明饰）单纯善良，暗恋大勇并主动示爱。令大勇和高婕的问题出现新的危机。此时，高婕发现嘉文过去曾在外国因为三角恋而放火杀人，正当要揭发这一段过去时，高婕的朋友离奇被杀。嘉文对过去的矢口否认也不像假装，大勇与高婕的误会加剧，事情的真相扑朔迷离。

杨沛聪（罗仲谦 饰），美雪（黄智雯 饰）等刚从医校毕业的新生，正式开始实习医生真枪实弹的工作。每个被分在神经外科的实习医生，都不禁对科室里的张一健（马国明 饰）医生又敬又畏，因其做事格外认真、一丝不苟的个性被医院上下称呼为“一件头”。他为了能实现双脚瘫痪的弟弟一康（魏焌皓 饰）去美国留学的心愿，一直拼命工作努力存钱，对个人感情的事避而不谈。直到范子妤（杨怡 饰）的出现，她不仅是一健导师的女儿，而且从小对医学充满热诚，对一健从仰慕之情转为爱慕之情。对于一健的回避，她反而采取主动，甚至在一康意外不幸离世之后，给伤心欲绝的一健安慰和鼓励，令其重拾医生的信念。正当一切好转之际，子妤被检查出脊髓内肿瘤中的星型细胞瘤，一健恍然大悟内心的情感……

女律师毛小慧（郑裕玲 饰）是个典型的事业型女性，自视甚高。事业得意的她爱情却是一片空白，寂寞的她万分期待爱情的来临。旅行归来后她看到公司发生了极大的变化，老板更安排了一个做事散漫、吊儿郎当的师爷余乐天（黄子华 饰）当她的助手，小慧虽然极不愿意但也无法抵抗老板的指示，小慧认为乐天是比她低级的男人，乐天也看不惯小慧的高傲自信，成了斗气冤家。最后更一同住进了老板因债务出售的豪宅中，斗嘴斗气的事仍然不停上演，作风大不相同的两人终日斗气，引发一个个幽默风趣的故事。

继续展现ICAC如何锲而不舍，打击层出不穷的贪污舞弊罪行，不让繁荣稳定的香港因一小撮人而负上沉重的代价。《廉政行动二○○四》分为五个单元剧，分别是由贩卖外国护照改编的“终极斗智”、由解款车走私案改编的“不一样的赌注”、改编自首宗因身为公职人员行为不当而犯罪的“以权谋私”、廉署同一时间调查两宗涉及税务贪污案件的“猎户天龙”，以及综合所有公营房屋短桩案而成的“短桩”。

金秉信（马国明 饰）本是法律系高材生，却因一次冤狱而决定开启法律行政人员之路。凭借八面玲珑的处事手腕，秉信逐渐建立“金师爷”金漆招牌。金师爷任职的律师楼突然面临倒闭，他运用人脉化解危局，还获律师田佑家（林夏薇 饰）、庾国栋（黄嘉乐 饰）加盟共事，并与大状马玮雄（张颕康 饰）组成新的法律界“最强CP”，解决各宗错综复杂的案件。

翠竹镇上有孟丽君（叶璇 饰），喜爱女扮男装出外求学淘气，才智过人天性聪慧的她是大夫孟士元的掌上明珠。机缘巧合下，男装打扮的她认识了同是乔装打扮的皇上铁穆耳（马德钟 饰）和憨直少年皇甫少华（林峰 饰）。孟丽君常听见暗夜笛声，早对吹笛人芳心暗许。家中早已安排好丽君与少华的婚事，怎奈由于彼此隐瞒的关系，丽君并不知道少华就是自己结拜的二哥，同时又误以为吹笛人就是铁穆耳，以致情根错钟。拒绝盲婚哑嫁的她带着丫鬟离家出走。

话说唐明皇一生风流重色，杨贵妃千娇百媚选在君王侧，集三千宠爱与唐明皇夜夜笙歌。所谓只见新人笑，可怜冷宫长夜的梅妃苦忆旧时情，于惆怅间寄语断肠诗，唐明皇读诗不忍，连夜驾幸，梅妃因怀有龙胎。但杨贵妃岂肯罢休，加上其兄杨国忠策谋，令二妃争宠成水深火热，忠臣钦天监力挽无从，最后更导致梅妃惨死后宫的悬案……时光飞逝，几道轮回，二十世纪的香港,康宝儿到广告公司应聘,无意将齐望月推入池中,后竟发现望月是广告公司主管,广告公司老板却认为宝儿是富星,不顾望月反对而聘用宝儿,望月一心认定宝儿是其克星,但在心地善良,待人真诚的宝儿终于感动了她,两人成为好朋友.

　警员陈富贵（王喜 饰）天资过人，刚从警察学校毕业就担起了卧底的重任，打入一犯罪集团内部搜刮它的首脑的罪证。犯罪集团追杀马来西亚新进女星梅香琴时，香港警方派出保护证人组保护她，陈富贵在暗中助她脱险时被保护证人组的探员关彦博（魏俊杰 饰）误会，以为他也是匪徒之一，于是大打出手。富贵凭借其机警灵活，摆脱了彦博的追捕。陈富贵完成卧底任务后，被调往保护证人组，与彦博成为拍挡。这群年轻人在保护证人组里一起面对各种艰险的挑战！

由黄日华、梁琤、刘锦玲、郭政鸿与及国内一班武术精英联合演出，把一代武术宗师广东十虎之一黄麒英惩恶扬善的传奇故事重现幕前。全剧武打场面别创一格，拳脚功夫招招新颖，加上全剧于云南昆明实地拍摄，明山异川，气势磅礡，倍添全剧豪情气概。清末，朝政腐败，民不聊生。药店少东黄麒英（黄日华）富正义感，拜南拳王陆阿采为师，练得一身好功夫。北腿王传人田慧男（梁琤），南下为父报仇，巧遇英，两人建立深厚情谊。富商独女宋绮文（刘锦玲）敬佩英的侠义行为，心生倾慕，但英却钟情男，而天生神力的铁桥三（郭政鸿）却又暗恋文……时莽古格尔（于连增）为两广总督，表面不懂武功，实得鹰爪功真传，武功高强，暗地里借白莲教之名，荼毒百姓。男杀父仇人苗卓峰为找寻鹰爪王南下，联同采创新招式欲破鹰爪功，惜二人同遭莽毒手，临终前将毕生武术分别传给英与男。后英以「虎鹤双型拳」大破白莲教，识破莽之阴谋，更与男联创「无影腿」破鹰爪杀莽，完成采、苗的遗愿。但英、男与文纠缠不清的三角关系，他们又如何自处呢？

好兄弟柳德荣（余德丞 饰）和齐轻舟（丁子朗 饰）为了考入艺员训练班，决心减肥、增高，并与香港小姐亚军姜之雁（刘颖镟 饰）、星二代温楚瑜（戴祖仪 饰）等人，努力追寻青春一片天。醉心演戏的轻舟为梦想挥洒汗水，但苦无出头机会；德荣却误打误撞一炮而红，两人的演艺路际遇多次交替逆转。德荣视之雁的亲姊姜之妍（伍乐怡 饰）为女神，及后发现默默守护自己的人竟是之雁。后來，轻舟凭无厘头喜剧成名，他与楚瑜的感情却经历离离合合。而一场续约风波，还令德荣、轻舟走到决裂的临界点……

叶菁（杨秀惠 饰）、叶荞（李思欣 饰）和叶茵（陈自瑶 饰）是情同手足的三姐妹，很小的时候，三人曾经于偶然之中遇见过一个神秘的吉普赛女郎（容祖儿 饰），吉普赛女郎预言，叶菁将在十八岁那一年遇见她的真命天子，辨别的标识就是此人身上长了一个如同四叶草一般的胎记。一晃眼多年过去，就读于清岚国际学校的三姐妹长大成人出落得亭亭玉立。校园内，清岚沙滩排球队声名远扬，其队长于逸臣（司徒瑞祈 饰）更是众女生们心目中的白马王子，让三姐妹没有想到的是，在他的身上，竟然出现了四叶草形状的胎记。然而，叶菁对这一段缘分却多有顾虑，于是叶荞和叶茵只得亲自出马，奔走撮合，谁知两人又在叛逆学生方力（蔡淇俊 饰）的身上发现了同样的胎记，一时之间，她们也无法分辨，叶菁命中注定的那个人究竟是谁。

阿芳（蓝洁瑛 饰）是两个孩子的母亲，这天她却莫名卷入了一起谋杀案。虽然丈夫带着两个孩子四处奔波为她讨回公道，但最终阿芳还是被判了死刑。随后丈夫也抛下两个儿子阿健（黄日华 饰）和阿康（温兆伦 饰）自杀了。云姨虽然只是医院的一名清洁工，收入不多，但不忍心看着两个孩子孤苦伶仃，于是收养了他们，此外云姨还收养了另外两个孤儿，一家五口过着清贫的生活。阿健16岁就为了生计放弃了学业，当了一名出租车司机。阿康十分争气，在大哥的供养下以优异的成绩从香港大学法律系毕业，顺利拿到了律师牌。阿康虽然十分能干，但他为人却十分残忍，为求目标不择手段；而阿健却正好相反，为人十分耿直，在是非面前绝不含糊。两个亲兄弟即将展开一段恩怨情仇！