第二部里，张大勇（陶大宇饰）与李忠义这对默契排档继续与狡猾凶狠的罪犯斗智斗勇。感情方面，大勇与高婕（郭可盈饰）成为斗嘴情侣，感情稳定增长。新来的女警员蓝嘉文（郭霭明饰）单纯善良，暗恋大勇并主动示爱。令大勇和高婕的问题出现新的危机。此时，高婕发现嘉文过去曾在外国因为三角恋而放火杀人，正当要揭发这一段过去时，高婕的朋友离奇被杀。嘉文对过去的矢口否认也不像假装，大勇与高婕的误会加剧，事情的真相扑朔迷离。
十五年的冤狱终得昭雪，石东升（黄日华 饰）出狱后不久即要求重回警队。在曾经的好友兼搭档米安定（苗侨伟 饰）的帮助下，石东升追查到当年案件的真相并将犯罪份子绳之以法。由于十五年前自己的证词间接造成石东升的冤狱，米安定一直对石东升心存歉意，在起初发觉石东升办案过程中滥用私刑之时，米安定试图劝阻。石东升一边假意奉承米安定，另一边却利用职务之便，扮演着“地下判官”的角色。石东升越陷越深，不仅依旧无视法规我行我素，而且把米安定当成自己“替天行道”的绊脚石，想办法来陷害米安定。为了维护法律的尊严和避免出现更多的受害者，米安定决定收集证据将石东升绳之以法。
三十年代的上海滩，黑帮横行、列强分割，要在这里闯出一片天，除了有实力，你还要比别人都要狠。于是，这里成了冒险家的乐园，成了机遇与成功的集散地。任鸿飞（张智霖 饰）和龙五（邵仲衡 饰）都是自幼父母双亡的孤儿，两个无依无靠的孩子成了结拜兄弟，互相帮忙着熬过了艰苦的成长岁月， 两人终于长大成人了。
女警姚自如（王敏奕饰）对周遭的声音、光影，甚至他人的情绪感受都特别敏感，凭此天赋解开凶案的迷思。如私下一脸“高冷”，甚少与人建立紧密关系，在旁人眼中，她是城市里的“旁观者”。“兔子洞”店长王觅希（周柏豪饰）希望每位食客能暂时抛开生活压力，放松心情享受“小确幸”。希的脸上永远挂着一抹微笑，他喜欢听客人的故事，却从不分享自己的故事。如查案时往往把情绪和感受投放进去，每当如与希闲聊后，有结未解的情绪便得以舒缓，久而久之两人愈见投契。
在一貧窮村落，有一位口才了得的狀師戴亞斗（鄭丹瑞）。村民每有任何冤情申訴，均禮聘他作其狀師， 斗因而聲名大噪。斗家乃狀師世家，種下不少冤孽，其母恐斗絕後，遂為他娶–童養媳梅群娥（崔加寶）。然而，斗卻對縣官商君綿（黃新）之女商湘（蔡少芬）情有獨鍾。
能够成为一名对社会有用的人一直都是张志杰（梁朝伟 饰）的理想，长大成人后，充满了正义感的他选择成为了一名警察。在与女友谢颖芝（张曼玉 饰）分手后，志杰接受了林佩贤（黄造时 饰）的追求，两人走到了一起。倪峰（刘青云 饰）是志杰的师兄，一次意外中，由于志杰的疏忽，倪峰遭遇 了车祸身负残疾，自暴自弃的他离开了警队，淡出了众人的视线。志杰有一同父异母的兄弟名为家明（戴志卫 饰），与志杰是同行，最近，家明因被卷入一宗诈骗案之中而遭到了追杀，杀手不是别人，正是消失已久的倪峰。家明死了，凶器竟然是志杰的配枪，志杰因此亦被卷入案中。为了证明自己的清白，志杰开始了对案件的调查。
杀虎案真凶子乐伏法，事情告一段落。干探浚森与韦力继续智破重重奇案。
河口悬本是个民风淳朴，山明水秀的好地方，可是上任不足一年的知县─厉之珏，办案手法胡涂，凡事包庇当地首富欧阳贵，为百姓所齿冷、不得民心，更被视为十年难得一见的「狗官」，背后更被谑称为「九公子」。其实厉之珏本性并不太坏，亦颇有聪明，考得功名后随父亲加入捕快行列，更因一次机缘巧合，救了当地富商欧阳贵，因而被欧阳贵看上，以金钱及手段为其打通关节，让厉之珏成为当地知县，作为自己在官场中的棋子。厉之珏当上县官后，亦曾有过抱负，冀望有所建树，令一众百姓安居乐业，可惜小舅父尤沾旺错手杀人，把柄为欧阳贵掌握，厉之珏只得无奈接受欧阳贵的操控，无论在办理案件，甚或在施行政策上皆以欧阳贵利益为依归，久而久之，办案和做人处世也变得得过且过，毫无原则。厉之珏有一未婚妻钟环，她一直对厉之珏千依百顺，然而在厉之珏当上县官之后，她对厉之珏的态度亦随之大变，从前温柔体贴的性格，演变成为...
受人尊敬的正义法官秦誉（张家辉 饰），为掩盖儿子交通肇事逃逸真相，不惜将自己拖入罪恶深渊，在法官职责与父亲身份间陷入两难，高级督察唐萱（胡杏儿 饰）在调查中发现端倪，逐步揭开案件背后隐藏的父爱牺牲与程序正义的冲突，一场关于父爱与正义的终极博弈就此展开。
1912年广州，清朝灭亡。前清武状元荣德（林嘉华饰）流落广州，落难时幸得顾坚诚（郑嘉颖饰）及妻子欧阳惠兰（杨怡饰）搭救。不料却是引狼入室，荣德不仅恩将仇报，还还得惠兰家破人亡。惠兰独自抚养儿女，一心要报这血海深仇。1936年，苦撑武馆20多年的惠兰（元秋饰），几经周折终于与失散多年的长子顾汝章（郑嘉颖饰）团聚。汝章回家后才得知二弟顾汝棠(马国明)身患重疾，以及与荣家的世仇。汝章本无心学武，但一次遇上荣德跋扈嚣张的儿子荣万钧(向佐)而大打出手，才让大家发现汝章是习武之材。惠兰祈望儿子为武馆重振雄风，为当年的血海深仇讨回公道。
暴雨不断，灾情肆虐，皇宫内，一击响雷击中祭台，将为民求晴的皇帝商天宝击落祭台。深夜，商天宝匪夷所思。次日，商天宝便独自离开皇宫，巡游而去……
意外怀孕令唐恬儿和叶致廷夫妻二人大失预算，本可寄望双方母亲的帮忙，可惜两老育婴方式南辕北辙，冲突频生，终请来陪月达人王佳妙救亡。因为BB来了，令恬儿狠心告别时尚爱美的事业，致廷要远离夜夜笙歌的品味人生，恬儿更为事业转型，毅然接手经营陪月中介公司，令恬儿对母亲这新身份别有一番体会，但与致廷却渐行渐远，更怀疑他与酒吧同事许晴有染；谁料致廷因一次意外中勇救小孩而成了网红的「绝世好爸」，带来翻天覆地的……
香港典型的小市民生（廖伟雄 饰）在一次救助富豪铎（刘兆铭 饰）后获得了一官半职，生以为这将是他平步青云、攀附名流的开始。然而，他并没有得到铎的支持，反而成为了铎的敌威针对的对象。同时，生的好友云（魏骏杰 饰）也因为铎的幼子驰（邓兆尊 饰）的作为而失去工作，并承受着各种欺凌。生一直暗恋的玉（陈梅馨 饰）原来并非生活如金玉般美好，而是有着内心的烦扰。生在失望和伤心之余，与玉姊莲（邓萃雯 饰）之间擦出了爱情的火花。然而，正当这段感情开始发展之际，威竟然用巨款收买生，要求他离开莲。这一切让生看透了豪门的种种百态，感到心灰意冷，决定抽身离开这个曾经让他存有幻想的地方。
