人心，是一门深奥的科学。人会犯罪作恶，皆因被贪婪、愤怒、软弱和嫉妒等情绪支配。为了逃避刑责，人会利用谎言掩饰真相，用诡计扰乱视线，令法证工作难上加难。未破的悬案、消失的证据、迷失的困局，都是法证团队面对的一个个难关。纵然过程中会受到打击，但他们都会坚持初心，跌倒之后重新出发，不会放弃追寻真相。《法证先锋V》的案件和布局更加让人意想不到，唯有靠着“法证部”、“法医科”及“重案组”这灭罪铁三角，秉承前四季的理念，通力合作，找出真凶，还生者公道，替死者雪冤。
杀虎案真凶子乐伏法，事情告一段落。干探浚森与韦力继续智破重重奇案。
河口悬本是个民风淳朴，山明水秀的好地方，可是上任不足一年的知县─厉之珏，办案手法胡涂，凡事包庇当地首富欧阳贵，为百姓所齿冷、不得民心，更被视为十年难得一见的「狗官」，背后更被谑称为「九公子」。其实厉之珏本性并不太坏，亦颇有聪明，考得功名后随父亲加入捕快行列，更因一次机缘巧合，救了当地富商欧阳贵，因而被欧阳贵看上，以金钱及手段为其打通关节，让厉之珏成为当地知县，作为自己在官场中的棋子。厉之珏当上县官后，亦曾有过抱负，冀望有所建树，令一众百姓安居乐业，可惜小舅父尤沾旺错手杀人，把柄为欧阳贵掌握，厉之珏只得无奈接受欧阳贵的操控，无论在办理案件，甚或在施行政策上皆以欧阳贵利益为依归，久而久之，办案和做人处世也变得得过且过，毫无原则。厉之珏有一未婚妻钟环，她一直对厉之珏千依百顺，然而在厉之珏当上县官之后，她对厉之珏的态度亦随之大变，从前温柔体贴的性格，演变成为...
1912年广州，清朝灭亡。前清武状元荣德（林嘉华饰）流落广州，落难时幸得顾坚诚（郑嘉颖饰）及妻子欧阳惠兰（杨怡饰）搭救。不料却是引狼入室，荣德不仅恩将仇报，还还得惠兰家破人亡。惠兰独自抚养儿女，一心要报这血海深仇。1936年，苦撑武馆20多年的惠兰（元秋饰），几经周折终于与失散多年的长子顾汝章（郑嘉颖饰）团聚。汝章回家后才得知二弟顾汝棠(马国明)身患重疾，以及与荣家的世仇。汝章本无心学武，但一次遇上荣德跋扈嚣张的儿子荣万钧(向佐)而大打出手，才让大家发现汝章是习武之材。惠兰祈望儿子为武馆重振雄风，为当年的血海深仇讨回公道。
香港典型的小市民生（廖伟雄 饰）在一次救助富豪铎（刘兆铭 饰）后获得了一官半职，生以为这将是他平步青云、攀附名流的开始。然而，他并没有得到铎的支持，反而成为了铎的敌威针对的对象。同时，生的好友云（魏骏杰 饰）也因为铎的幼子驰（邓兆尊 饰）的作为而失去工作，并承受着各种欺凌。生一直暗恋的玉（陈梅馨 饰）原来并非生活如金玉般美好，而是有着内心的烦扰。生在失望和伤心之余，与玉姊莲（邓萃雯 饰）之间擦出了爱情的火花。然而，正当这段感情开始发展之际，威竟然用巨款收买生，要求他离开莲。这一切让生看透了豪门的种种百态，感到心灰意冷，决定抽身离开这个曾经让他存有幻想的地方。
Jackie（蔡少芬 饰）罹患脑癌后一直昏迷，程至美（吴启华 饰）一直守候照顾。至美的用情专一深深感动了同一所医院的医生何心研（蒙嘉慧 饰）。富家女出身的心研跟风流医生林敏智（陈豪 饰）本是恋人，遇上了至美才让她看到了细水长流的爱情。
阿哲（吴启华 饰）年纪轻轻就成了全港十大基金经理之一，一直在位于中环某间投资公司工作。阿哲的上司是个心胸狭窄的人，一次他收到了内幕却故意不透露给阿哲，致使阿哲投资失利，在公司的地位一下跌到了谷底，随后更是千方百计排挤他。阿哲忍无可忍，决定自己出来自立门户开投资公司，手下阿昌（阮兆祥 饰）决定跟随他一起出来创业。虽然两人满腹宏图大计，但缺乏启动资金，阿哲想起父亲在大澳老家有一块地，于是决定回将土地转让以期获套取现金。阿哲、阿昌回到大澳，认识了当地女孩开心（陈松伶 饰）以及她的一家人。开心的父亲根叔（元华 饰）是这里的村长，他家里的虾膏厂正好盖在阿哲父亲的那块土地上。阿哲打听到村里唯一能证明这块地是自己父亲的人忠伯已经移居外地，恰巧他们又错过了刚刚回来探亲的忠伯，于是两人只好先居住在大澳等忠伯再次回来。根叔误以为阿哲和开心已经爱上对方，于是开始极力撮合两人，闹了不少笑话。而阿哲与开心相处日久，两人亦渐生情愫。
剧集以隐形任务战略部队及反恐特勤队作为剧集主题，讲述一众反恐精英与不法份子掀起连场激斗的故事。
民国初年社会动荡不安，军阀割据导致民不聊生。一张遗落世间的藏宝图引来袁世凯部下督军、日本特务、革命党人等各方势力的秘密追踪。南方政府特务沈玉茹（周慧敏饰）为追查这张藏宝图的下落而潜入戏班。在争夺藏宝图的争斗中，玉茹目睹父亲被射杀，悲痛异常的她意外失足跌倒导致失忆，流落街头。
讲述三个年青人，各自背负不同的背景和遭遇，于八十年代的香港相遇——娴及丈夫根偷渡来港，但只有根能安然抵步，根误以为娴及儿子海已死，心灰意冷之际得老板器重，更将爱女中下嫁，生得一子文。二十年后，终与根相认。海羡慕文得天独厚，对文轻易夺得好友南之妹媛的芳心更生妒意，自卑下埋首工作，终取得根信任。期间，文与海分别认识由台湾来港的路。因为上一代的误会，路对潦倒好赌的父亲泉盲目维护，一直无法原谅生母娥。路后得商界名女人珊赏识，二人成为好友。某次大陆之行，海误撞死一途人，为求自保，竟令文入狱。怎料过程被新目击，海怕东窗事发，将新推落悬崖。后来更将怀有自己骨肉的俐抛弃。文在狱中受尽折磨，整个人变得踏实刻苦。路更对文由怜生爱，但为了与媛的姊妹情，强自抑压对文的爱意。文出狱后，发觉自己所有的不幸，竟是海一手安排，决心作出反击，从此兄弟决裂……
周劍虹（梁朝偉）因母親當年的一段三角戀愛，竟令他出世後不知生父是誰。母親生他時難產而死，他就由兩個父親周榮及鄒有共同撫養。劍虹大學畢業後，先結識女督察謝碧華（翁美玲）及女律師林少文（陳敏兒），兩人均在他心中留下印象。劍虹在一珠寶公司覓得理想工作後，便努力爭取表現。在一次洽談生意中發現上司及一些同事瞞著公司，從中漁利，遂向董事長楊兆安投訴，因而甚受賞識。兆安外孫江天偉（呂良偉）經劍虹介紹而認識少文，遂展開追求；與此同時，少文知悉劍虹只視自己為知己，故接受了天偉的愛意。但劍虹、碧華、天偉及少文間感情發展，忽離又合，始終糾纏不清。此外，兆安無意中查悉周榮竟是他前妻所生的兒子，劍虹便是其孫，大感興奮，決栽培劍虹，讓他日後接管珠寶公司。此事給其子楊志堅知悉，大為憤怒，決要清除異己，實行他的奪權大計…
单元个案：惩教署发现监狱内有犯人不断收到违禁物品，高层怀疑有职员协助非法偷运。负责的调查员是陈锦鸿饰，亲自到惩教署深入调查，熟识内部运作方便找出犯人。他锁定其中一名犯人黄德斌，因他与女友袁彩云感情佳，入狱后又得到违禁品。最后揪出一名因欠下赌债的二级惩教助理阮兆祥，并当场在其身上搜获违禁品，并将涉案人等一网打尽。真实个案：2001年，台北监狱受刑人勾结管理员在狱中贩毒被发现，一名吴姓受刑人涉嫌行贿狱政人员，利用手机，遥控外面的伙伴进行毒品交易。
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